Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl3P27659 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl3P27659 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms