Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ggta1P23336 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ggta1P23336 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms