Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rpl13aP19253 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rpl13aP19253 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rpl13aP19253 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rpl13aP19253 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rpl13aP19253 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rpl13aP19253 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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