Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18530 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18530 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18530 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18530 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18530 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P18530 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P18530 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P18530 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P18530 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18530 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18530 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18530 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P18530 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18530 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18530 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18530 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18530 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18530 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18530 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18530 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P18530 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P18530 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms