Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CnpP16330 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CnpP16330 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CnpP16330 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CnpP16330 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CnpP16330 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CnpP16330 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CnpP16330 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CnpP16330 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CnpP16330 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CnpP16330 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CnpP16330 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CnpP16330 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CnpP16330 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CnpP16330 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CnpP16330 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CnpP16330 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CnpP16330 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CnpP16330 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CnpP16330 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CnpP16330 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CnpP16330 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CnpP16330 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CnpP16330 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CnpP16330 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CnpP16330 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CnpP16330 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CnpP16330 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CnpP16330 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CnpP16330 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CnpP16330 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CnpP16330 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CnpP16330 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CnpP16330 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CnpP16330 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CnpP16330 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CnpP16330 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CnpP16330 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CnpP16330 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CnpP16330 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CnpP16330 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CnpP16330 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CnpP16330 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CnpP16330 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CnpP16330 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CnpP16330 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CnpP16330 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CnpP16330 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CnpP16330 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CnpP16330 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CnpP16330 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CnpP16330 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CnpP16330 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CnpP16330 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CnpP16330 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CnpP16330 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CnpP16330 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CnpP16330 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CnpP16330 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CnpP16330 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CnpP16330 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CnpP16330 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CnpP16330 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CnpP16330 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CnpP16330 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CnpP16330 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CnpP16330 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms