Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Defa1P11477 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Defa1P11477 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms