Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc9P09633 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxc9P09633 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms