Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax1P09084 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax1P09084 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax1P09084 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax1P09084 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax1P09084 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms