Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxa1P09022 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxa1P09022 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms