Protein–RNA interactions for Protein: P04235

Cd3d, T-cell surface glycoprotein CD3 delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3dP04235 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cd3dP04235 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd3dP04235 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms