Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01661 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
P01661 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
P01661 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01661 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01661 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01661 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01661 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01661 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01661 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01661 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01661 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01661 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01661 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01661 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01661 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01661 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01661 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01661 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01661 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01661 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01661 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
P01661 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01661 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01661 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01661 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01661 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01661 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms