Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P01659 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01659 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01659 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01659 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01659 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01659 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P01659 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01659 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P01659 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P01659 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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P01659 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P01659 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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P01659 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01659 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01659 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01659 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01659 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01659 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P01659 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01659 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01659 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01659 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01659 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01659 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P01659 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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P01659 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P01659 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01659 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01659 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01659 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01659 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01659 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01659 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01659 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01659 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01659 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01659 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01659 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P01659 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01659 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01659 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01659 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01659 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01659 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01659 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P01659 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms