Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
F11rO88792 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
F11rO88792 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
F11rO88792 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
F11rO88792 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
F11rO88792 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
F11rO88792 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
F11rO88792 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
F11rO88792 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
F11rO88792 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
F11rO88792 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
F11rO88792 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
F11rO88792 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
F11rO88792 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
F11rO88792 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
F11rO88792 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
F11rO88792 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
F11rO88792 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
F11rO88792 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms