Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cops4O88544 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cops4O88544 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cops4O88544 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cops4O88544 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms