Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lnx1O70263 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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