Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxq1O70220 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxq1O70220 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms