Protein–RNA interactions for Protein: O70172

Pip4k2a, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4k2aO70172 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pip4k2aO70172 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pip4k2aO70172 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms