Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb5O55234 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb5O55234 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb5O55234 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms