Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp26a1O55127 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp26a1O55127 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp26a1O55127 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms