Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nipsnap2O55126 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap2O55126 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms