Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syngr1O55100 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Syngr1O55100 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syngr1O55100 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms