Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsf12O54907 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsf12O54907 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms