Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccr6O54689 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr6O54689 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccr6O54689 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms