Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ppt2O35448 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppt2O35448 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms