Protein–RNA interactions for Protein: O35181

Nrg3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrg3O35181 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nrg3O35181 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrg3O35181 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms