Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Kcns1O35173 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcns1O35173 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Kcns1O35173 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Kcns1O35173 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Kcns1O35173 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Kcns1O35173 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcns1O35173 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Kcns1O35173 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms