Protein–RNA interactions for Protein: O35127

Grcc10, Protein C10, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grcc10O35127 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Grcc10O35127 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Grcc10O35127 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms