Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Scarb2O35114 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Scarb2O35114 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms