Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Casq1O09165 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Casq1O09165 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casq1O09165 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casq1O09165 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casq1O09165 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Casq1O09165 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms