Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrkcshO08795 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PrkcshO08795 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms