Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm5294J3QP53 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm5294J3QP53 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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