Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Arfip1G5E8V9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms