Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vmn1r12G5E8G1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r12G5E8G1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms