Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hmgxb3G3X9M3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hmgxb3G3X9M3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hmgxb3G3X9M3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms