Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trim15G3UY57 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Trim15G3UY57 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim15G3UY57 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim15G3UY57 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim15G3UY57 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim15G3UY57 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim15G3UY57 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim15G3UY57 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim15G3UY57 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim15G3UY57 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim15G3UY57 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Trim15G3UY57 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Trim15G3UY57 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms