Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx1-1G3UXB3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nkx1-1G3UXB3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx1-1G3UXB3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms