Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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Gm5798F7BTS7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm5798F7BTS7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm5798F7BTS7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm5798F7BTS7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm5798F7BTS7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm5798F7BTS7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm5798F7BTS7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Gm5798F7BTS7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm5798F7BTS7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm5798F7BTS7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5798F7BTS7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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