Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc171E9Q1U1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc171E9Q1U1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
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