Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ddx60E9PZQ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ddx60E9PZQ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ddx60E9PZQ1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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