Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rsph10bE9PYQ0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rsph10bE9PYQ0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph10bE9PYQ0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms