Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms