Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms