Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc170D3YXL0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms