Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN2

Igsf23, Immunoglobulin superfamily, member 23, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf23B2RTN2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Igsf23B2RTN2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igsf23B2RTN2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms