Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nipsnap3aB1AWZ3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3aB1AWZ3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms