Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PtpruB1AUH1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PtpruB1AUH1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PtpruB1AUH1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PtpruB1AUH1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtpruB1AUH1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PtpruB1AUH1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
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