Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHL33A6NCF5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL33A6NCF5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms