Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lgr4A2ARI4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lgr4A2ARI4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lgr4A2ARI4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lgr4A2ARI4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lgr4A2ARI4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lgr4A2ARI4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lgr4A2ARI4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lgr4A2ARI4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lgr4A2ARI4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr4A2ARI4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr4A2ARI4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr4A2ARI4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr4A2ARI4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr4A2ARI4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr4A2ARI4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr4A2ARI4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr4A2ARI4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lgr4A2ARI4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr4A2ARI4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr4A2ARI4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr4A2ARI4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lgr4A2ARI4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms