Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ambra1A2AH22 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ambra1A2AH22 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms