Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf19bA2A7Q9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf19bA2A7Q9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf19bA2A7Q9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf19bA2A7Q9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rnf19bA2A7Q9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf19bA2A7Q9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf19bA2A7Q9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf19bA2A7Q9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rnf19bA2A7Q9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnf19bA2A7Q9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf19bA2A7Q9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf19bA2A7Q9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf19bA2A7Q9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf19bA2A7Q9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf19bA2A7Q9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnf19bA2A7Q9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms